gDNA extraction from Candida albicans and Candida dubliniensis in subgingival samples in Argentina. Evaluation of different methods / Evaluación de diferentes métodos de extracción de gADN en Candida albicans y Candida dubliniensis en muestras subgingivales en Argentina

ABSTRACT The oral cavity constitutes a unique ecosystem with highly variable ecological niches that harbor a great variety of microorganisms, including yeasts. Molecular methods are currently considered the gold standard for identifying species, although they involve limitations associated with the disruption of yeast cell walls to release the genomic DNA (gDNA) for amplification. Aim: The aim of this study was to compare the performance of different methods for extracting gDNA from Candida albicans and Candida dubliniensis, subsequently amplifying DNA by PCR. Materials and Method: Fifty-two isolates (16 C. albicans and 36 C. dubliniensis) were obtained from subgingival biofilm of HIV+ patients with clinical signs of periodontal disease. The study evaluated 6 gDNA extraction methods and two PCR amplification methods. Furthermore, the presence of alleles of HWP1 gene was determined in C. albicans. Results: Comparisons of six methods show statistically significant differences (p<0.001) except for C. albicans in two of them. For C. dubliniensis, statistical differences were observed in all comparisons. Commercial methods were more efficient for concentrating gDNA than in-house methods, and both PCRs were effective. Ten heterozygous C. albicans isolates for this allele were positive for the HWP1-1 / HWP1-2 allele, one was homozygous for Wild Type HWP1-1 allele, and 5 were homozygous for novel/rare HWP1-2 allele. Conclusions: This study aims to provide simple, inexpensive strategies for phenotypic identification and molecular confirmation of Candida albicans and Candida dubliniensis for non-reference laboratories with low complexity and/or low budgets.

RESUMEN La cavidad oral constituye un ecosistema único con nichos ecológicos muy variables, capaz de albergar una gran variedad de microorganismos, incluidas las levaduras. Los métodos moleculares son considerados actualmente los métodos de identificación definitivos ya que a diferencia de los anteriores, nos brindan una correcta sensibilidad y especificidad. Sin embargo, existen limitaciones asociadas con la ruptura de las paredes celulares de estas levaduras para liberar el ADN genómico (gADN) necesario para la amplificación. Objetivo: El objetivo de este estudio fue comparar el rendimiento de diferentes métodos de extracción de gADN de Candida albicans y Candida dubliniensis, amplificando posteriormente por PCR. Materiales y Método: Se estudiaron 52 aislamientos, 16/52 de Candida albicans y 36/52 de Candida dubliniensis obtenidos de biofilm subgingival de pacientes VIH+ con signos clínicos de enfermedad periodontal. Se evaluaron seis métodos de extracción de gADN y la posterior amplificación se realizó por dos técnicas de PCR. Además en C. albicans se determinó la presencia de alelos para el gen HWP1. Resultados: Las comparaciones de seis métodos son estadísticamente significativas (p<0,001) excepto para C. albicans en dos de ellos. Para C. dubliniensis se observaron diferencias estadísticas en todas las comparaciones. Los métodos comerciales mostraron una mayor eficiencia en la concentración de gADN que los métodos caseros y ambos fueron efectivos en las dos PCR. 10 aislados de C. albicans resultaron positivos para el alelo HWP1-1/HWP1-2, siendo heterocigotos para este alelo. Solo un aislamiento fue homocigoto para el alelo HWP1-1 de tipo salvaje y 5 eran homocigotos para el alelo HWP1-2 nuevo/raro. Conclusiones: Este estudio tiene como objetivo proporcionar estrategias simples y económicas para la identificación fenotípica y confirmación molecular de Candida albicans y Candida dubliniensis para laboratorios de no referencia con baja complejidad y/o bajo presupuesto económico.

Clinical and microbiological assessment in a subpopulation of young Argentine patients with severe periodontitis / Periodontitis severa en jóvenes argentinos. Evaluación clínica y microbiológica en jóvenes argentinos con periodontitis severa

ABSTRACT Aggressive periodontitis (AP) is the most serious entity of periodontal disease (stage III/IV, grade C periodontitis according to the latest classification, 2017). Aim: to enhance knowledge of periodontal microbiota in AP in native Argentine patients and describe the effect of a combined pharmacological-mechanicalperiodontal treatment on clinical and microbiological parameters. Materials andMethod: The study analyzed 42 periodontal sites in 11 patients diagnosed with AP. Clinical periodontal parameters were recorded at baseline, 45, 90 and 180 days. Microbiological samples were taken before treatment and at 180 days. PCR was used to determine presence of the periodontopathic bacteria Aggregatibacter actinomycetemcomitans (Aa), Porphyromonas gingivalis (Pg), Tannerella forsythia (Tf), Treponema denticola (Td), Prevotella intermedia (Pi) and Fusobacterium nucleatum (Fn). Patients underwent periodontal therapy including antibiotics (Amoxicillin 500mg + Metronidazole 250mg; 8hs/7 days), and were reevaluated at 45, 90 and 180 days. Results: Mean age was 28.4 ± 7.9 years. The initial PCR detected the following frequencies: Aa 14.3%, Pi 61.9%, Pg 71.4%, Tf 81.0%, Fn 95.2% and Td 97.6%. Baseline microbiological samples revealed significantly higher prevalence of Pg over Aa (p=0.012). Clinical parameters improved significantly after treatment (73.8% PS<5 mm; PS, NIC, SS p<0.001). At 180 days, a significant decrease in microbiological detection rates was observed (Fn, Td, Tf, Pi, Aa p<0.05). Aa was no longer detectable while Pg did not decrease significantly (p=0.052). Fn was the only study species detected in 100% (n=11:42) of residual pockets (PS>5 mm) (p=0.053). Conclusion: In the initial samples, there was significant prevalence of Pg over Aa. Significant clinical improvement was achieved after the mechanical-pharmacological treatment, with undetectable levels ofAa, while Fn persisted in residual pockets, and Pg was present at most of the treated sites.

RESUMEN La periodontitis agresiva (PA) es la entidad más grave de la enfermedad periodontal (clasificación 2017: periodontitis estadio III/IV, grado C). Objetivo: mejorar el conocimiento sobre la microbiota periodontal de la PA en sujetos nativos argentinos y describir el efecto de un tratamiento mecánico-farmacológico periodontal sobre los parámetros clínicos y microbiológicos. Materiales y Método: se estudiaron 42 sitios periodontales correspondientes a 11 pacientes con PA. Los parámetros clínicos se registraron a 0, 45, 90 y 180 días. Las tomas microbiológicas se realizaron antes de iniciar el tratamiento y a los 180 días. La determinación de especies periodontopáticas (Aggregatibacter actinomycetemcomitans (Aa), Porphyromonas gingivalis (Pg), Tannerella forsythia (Tf, Treponema denticola (Td), Prevotella intermedia (Pi) y Fusobacterium nucleatum (Fn)) se realizó por PCR. Los pacientes iniciaron terapia básica periodontal junto con antibioticoterapia (Amoxicilina 500 mg + Metronidazol 250 mg; 8 hs/7 días) y fueron evaluados a los 45, 90 y 180 días. Resultados: la edad media fue 28,4 ± 7,9 años. Las detecciones iniciales fueron: Aa 14,3%, Pi 61,9%, Pg 71,4%, Tf 81,0%, Fn 95,2% y Td 97,6%. En las muestras iniciales la prevalencia de Pg sobre Aa fue significativamente superior (p=0,012). Los pacientes tuvieron una respuesta clínica favorable al tratamiento (73,8% PS<5 mm; PS, NIC, SS p<0,001). A 180 días, se observó una disminución estadísticamente significativa en la detección microbiana (Fn, Td, Tf, Pi, Aa p<0,05). En igual plazo, Aa no fue detectado, mientras que Pg mostró una disminución no significativa (p=0,052). Fn fue el único detectado en el 100% (n=11:42) de las bolsas periodontales residuales (PS>5 mm) (p=0,053). Conclusión: Las muestras iniciales evidenciaron prevalencia significativa de Pg sobre Aa. El tratamiento logró una significativa mejora clínica con niveles indetectables de Aa. La persistencia de Fn en las bolsas residuales y de Pg en la mayoría de los sitios tratados, caracterizaron la muestra poblacional estudiada.

Saliva sampling methods. Cariogenic streptococci count using two different methods of saliva collection in children / Recuento de estreptococos cariogénicos a partir de dos métodos de obtención de saliva en niños

ABSTRACT The aim of this study is to compare the efficacy of two methods for collecting saliva samples from infants under 2 years of age for cariogenic streptococci (CS) count. Two collection methods were applied in 11 infants. In Method (A), saliva samples were collected by swabbing the inner cheek mucosa and floor of the mouth in figure of eight motions with a sterile cotton swab until it was soaked. In method (B), saliva samples were collected by aspiration of 1 ml of saliva with a sterile plastic syringe on the floor of the mouth, after stimulation with glove. The samples were cultured in modified Gold's broth (MSMG), and on trypticase, yeast extract, sucrose, cystine and bacitracin culture medium (TYSCB). In method (A), the swab with the sample was unloaded in situ on TYSCB and placed in PBS medium for transport. Then, 100 μl of the eluate was seeded in MSMG. In method (B) 100 μl were seeded in TYSCB and 100 μl in MSMG. Both culture media were incubated under capnophilic conditions for 48 hours at 37 °C. Colony forming units (CFU/ml) were counted by calibrated operators (kappa = 0.75). The presence of cariogenic streptococci (CS) (Streptococcus mutans-Streptococcus sobrinus) was determined by qPCR in the samples collected by both methods. The CFU/ml counts in MSMG differed significantly between methods (p = 0.021). In TYSCB, the recovery of CFU/ml was higher in method (A), without significant difference (p = 0.705). The molecular technique detected presence of CS, with no difference between collection methods. Collecting saliva samples by swabbing proved more effective in terms of recovery of microorganisms, and did not affect the detection of presence of CS by molecular techniques.

RESUMEN El objetivo de este estudio es comparar la eficacia de dos métodos de obtención de muestras salivales, en infantes menores de 2 años para el recuento de estreptococos cariogénicos (EC). Se aplicaron dos métodos de recolección en 11 infantes, el método (A), consistió en la recolección de muestras de saliva con hisopos de algodón estériles, realizando movimientos en ocho sobre la mucosa del carrillo y piso de boca, hasta embeber el hisopo. En el método (B) la recolección de las muestras se realizó por aspiración con jeringa plástica estéril en piso de boca hasta obtener 1 ml, luego de estimulación con guante. Las muestras fueron cultivadas en caldo de Gold modificado (MSMG) y medio de cultivo TYSCB (tripticasa, extracto de levadura, sacarosa, cistina y bacitracina). En (A), el hisopo con la muestra fue descargado in situ en TYSCB y colocado en medio de transporte PBS. 100 μl del eluato se sembró en MSMG. En (B) 100 μl fueron sembrados en TYSCB y 100 μl en MSMG. Ambos medios de cultivo fueron incubados en condiciones de capnofilia por 48 hs. a 37°C. El recuento de unidades formadoras de colonias (UFC/ml) se realizó por operadores calibrados (kappa= 0.75). La presencia de EC (Streptococcus mutans - Streptococcus sobrinus) fue determinada por qPCR en las muestras obtenidas por ambos métodos. Los resultados mostraron que los recuentos de UFC/ml en MSMG presentaron diferencias significativas entre ambos métodos (p=0.021) En TYSCB la recuperación de UFC/ml fue mayor en el método (A), sin observarse diferencias significativas (p=0.705). Se detectó la presencia de EC por técnica molecular, sin mostrar diferencias entre los métodos empleados. La recolección de muestra de saliva con hisopo presentó mayor eficacia en términos de recuperación de microorganismos, sin alterar la detección de presencia de EC por técnicas moleculares.

Enzyme production by Candida albicans and Candida dubliniensis in periodontal HIV-positive patients receiving and not receiving antiretroviral therapy / Producción enzimática de Candida albicans y Candida dubliniensis de pacientes con periodontitis VIH+ con y sin tratamiento antirretroviral

ABSTRACT Candida dubliniensis (Cd) and Candida albicans (Ca) are the most frequently isolated yeasts in HIV+ patients. Some of the enzymes produced by these yeasts are considered virulence factors since they contribute to pathogenicity of Candida spp. The aim of the present study was to compare production of enzymes such as phospholipase (Ph), proteinase (P), and hemolysin (H) by Cd and Ca strains isolated from periodontal HIV-positive patients receiving and not receiving highly active antiretroviral therapy (HAART). Subgingival biofilm samples were obtained using paper points, and a sample of oral mucosa was taken using a swab. Phenotypic and molecular methods were used to isolate 39 strains of Candida, including 25 strains of Cd and 14 strains of Ca, obtained from 33 periodontal pocket samples and 6 oral mucosa samples collected from 15 HIV+ patients (8 receiving and 7 not receiving HAART). Malt egg-yolk agar, albumin agar and blood agar were used to evaluate pH, P and H production respectively. The strains were inoculated in duplicate and incubated at 37 ºC. Colony and halo diameters were measured. A greater proportion of Ca was observed in patients not receiving HAART, and a higher proportion of Cd was observed in those under HAART, Chi2 p< 0.001. Phospholipase production was observed in 92.9% percent of isolated Ca strains but in none of the isolated Cd strains. Proteinase production was high in Ca and Cd strains isolated from patients not receiving HAART. Hemolysin production was observed in all the studied strains, though it was significantly higher (p=0.04) in Ca and Cd strains isolated from patients not receiving HAART. To sum up, the proportion of Candida dubliniensis strains was highest in the subgingival biofilm of patients receiving HAART, and Cd strains were found to express fewer virulence factors than Ca strains.

RESUMEN Las levaduras más aisladas en pacientes VIH+ son Candida dubliniensis (Cd) y Candida albicans (Ca). Algunas de sus enzimas constituyen factores de virulencia ya que favorecen la diseminación tisular. El objetivo fue comparar la producción de enzimas como fosfolipasa (F), proteinasa (P) y hemolisina (H) en cepas de Cd y Ca aisladas de pacientes VIH+ tratados y no tratados con antirretrovirales (TARGA). Se realizó la toma del biofilm de placa subgingival con conos de papel y la muestra de la mucosa bucal con hisopo. Se aislaron y tipificaron por métodos fenotípicos y moleculares 39 cepas: 25 de Cd y 14 Ca, obtenidas 33 de bolsas periodontales y 6 de mucosa bucal de 15 pacientes VIH+ (8 con y 7 sin tratamiento). Se utilizó agar malta con yema de huevo, agar albúmina y agar sangre para demostrar la producción de F, P y H, respectivamente. Se inocularon por duplicado e incubaron a 37°C. Se midieron los diámetros de las colonias y los de hidrólisis alrededor de las mismas. Se observó mayor proporción de Ca en los pacientes sin tratamiento y mayor proporción de Cd en los con tratamiento; Chi2 p< 0.001. El 92,9% de las Ca estudiadas, fueron productoras de fosfolipasa. En tanto que ninguna Cd produjo la enzima. En cuanto a la producción de proteinasa se observa una alta producción tanto en las cepas de Ca, como en las Cd aisladas en los pacientes no tratados. Todas las cepas estudiadas produjeron hemolisina, observándose una diferencia estadísticamente significativa (p=0,04) en ambas especies a favor de la alta producción de la enzima en las cepas obtenidas de pacientes no tratados. Podemos concluir que en el biofilm subgingival, en los pacientes bajo TARGA, se aíslan mayor proporción de Candida dubliniensis las cuales expresan menos factores de virulencia.

Validation of an adherence assay to detect group mutans streptococci in saliva samples / Validación del Test de adherencia para el recuento de estreptococcos del grupo mutans en muestras de saliva

The aim of the present study was to validate and establish a cut off point and the predictive value of an adhesion test (AA-MSMG), as a microbiological method for evaluating cariogenic risk. The study is based on a variant (20% sucrose) of a selective medium descripted by Gold et al. (MSMG). This method differentiates mutans group streptococci (MGS) by exacerbating the production of insoluble extracellular polysaccharide which gives adhesion to surfaces such as glass, plastic and dental enamel. Caries assessment according to ICDAS was conducted in 154 patients (aged >21 years) who were attended at Preventive and Community Dentistry Department, School of Dentistry, University of Buenos Aires, Argentina, between August 2017 to August 2018. The study population was assigned to groups according to the presence/ absence of caries lesions: Group A: ICDAS lesion code = 0 (L=0) on all dental surfaces (n=23); and Group B: L>1 (n=131). After mouth-rinsing with distilled water, saliva samples were collected with fasting and hygiene protocol, and sent immediately to the Microbiological Diagnosis Laboratory, Microbiology Department, School of Dentistry, University of Buenos Aires. Samples were homogenized and serially diluted to the tenth. 100 pl of the dilutions were cultured in 25 cm² sterile plastic flasks containing 9.9 ml of modified selective medium described by Gold (MSMG-selective and differential medium). Cultures were incubated in an anaerobic atmosphere at 36 ± 1°C for 48 hours. The supernatants were eluted and the samples washed with sterile distilled water. Colony forming unit counts were performed by calibrated researchers (Kappa >0.75) using a stereoscopic microscope at 50X. Mutans group streptococci (MGS) counts ranged from 1x10(4) to 1x10(5) CFU/ml in group A, and were higher than 1x10(6) CFU/ml in Group B. Statically analysis of results (ROC) showed that the AAMSMG has a satisfactory predictive value (91%) and established a cutoff point in 1.68x10(5) UFC / ml. This would indicate that individuals whose MGS saliva counts are higher than the cutoff value would be 5 times more likely to develop dental caries. Adherence assay could be a useful microbiological predictor of caries risk.

El objetivo del presente estudio fue validar, establecer el punto de corte y valor predictivo de una técnica microbiológica para evaluar el nivel de estreptococos del grupo mutans en saliva. La técnica consiste en un test de adherencia que emplea un medio selectivo modificado (20% sacarosa) descripto por Gold et al. (TA-MSMG). Este método permite diferenciar a los estreptococos del grupo mutans (SGM) exacerbando la producción del polisacárido extracelular insoluble que le confiere adhesión a superficies como vidrio, plástico y esmalte dental. De acuerdo con los criterios de ICDAS se sembraron 154 salivas de pacientes mayores de edad, que asistieron al Servicio de Odontología Preventiva y Comunitaria de la Facultad de Odontología de la Universidad de Buenos Aires entre los meses de agosto de los años 2017 y 2018. La población estudiada fue asignada a dos grupos según la presencia / ausencia de lesiones de caries: Grupo A: código de lesión ICDAS = 0 (L = 0) en todas las superficies dentales (n = 23); y Grupo B: L> 1 (n = 131). Después de realizar un enjuague bucal con agua destilada, las muestras de saliva se recogieron según protocolo (ayuno de 4 horas y suspensión de higiene dental de 12 hs). Las muestras se remitieron de inmediato al Laboratorio de Diagnóstico Microbiológico, Departamento de Microbiología de la Facultad de Odontología, Universidad de Buenos Aires. Para su procesamiento, las muestras fueron homogeneizadas y diluidas al décimo. Se cultivaron 100 pl de las diluciones en botellas de plástico estériles de 25 cm² que contenían 9,9 ml de medio de Gold modificado (MSMG-20% sacarosa). Los cultivos se incubaron en atmósfera anaeróbica a 36 ± 1°C durante 48 horas. El sobrenadante se eluyó y las muestras se lavaron con agua destilada estéril. Los recuentos de unidades formadoras de colonias SGMfueron realizados por investigadores calibrados (Kappa >0.75) utilizando un microscopio estereoscópico a 50X. Los recuentos de SGM presentaron una variación entre 1x10(4)y 1x10(5) UFC/ml en el grupo A, mientras que en el Grupo B fueron superiores a 1x10(6) UFC/ml. El análisis estadístico de los resultados determinó una curva ROC que establece para el TA-MSMG un valor predictivo del 91% y un punto de corte en 1.68x10(5) UFC SGM / ml. Esto indicaría que los individuos cuyos recuentos en saliva de SGM sean superiores al valor de corte, tendrían 5 veces más posibilidades de desarrollar caries (5:1). Este método podría ser un instrumento útil al momento de evaluar (indicador microbiológico) el riesgo cariogénico del paciente.

Actinomicosis cervicofacial en niños / Cervicofacial actinomycosis in children

La actinomicosis cervicofacial es una enfermedad endógena no contagiosa, supurativa y generalmente localizada con tendencia a la fistulización. Sus agentes etiológicos son bacterias del género Actinomyces cuyo hábitat natural son zonas con baja tensión de oxígeno de la cavidad bucal. La causa desencadenante para que se produzca es el trauma quirúrgico accidental. Es considerada una enfermedad de la edad adulta, sin embargo nuestra experiencia nos permite asegurar que también se produce en la niñez, a partir de la presencia de dientes en la cavidad bucal. El objetivo de esta comunicación es presentar dos casos clínicos de niños derivados a la Cátedra de Microbiología de la FOUBA para realizar el diagnóstico microbiológico de actinomicosis

Control de la infección en odontología: 3a. parte / Infection control in dentistry: 3rd part

La atención odontológica requiere de condiciones asépticas y para lograrlas se deben implementar medidas referidas a la protección personal, empleo criterioso de los antisépticos, desinfectantes, métodos adecuados de esterilización y tratamiento de residuos patogénicos. Para esta tercera parte, el protocolo propuesto contiene las acciones postatención que incluyen el tratamiento del material de un solo uso, del equipo, de las superficies de aerolización, de las impresiones, modelos, cubetas y del instrumental hasta completar la esterilización considerando los métodos de control de calidad

Control de la infección en odontología: parte II / Infection control in dentistry: part II

Para el control de la infección en la clínica odontológica se deben considerar los riesgos generales y los propios para cada especialidad. La atención odontológica requiere de condiciones asépticas y para lograrlas han sido implementadas medidas referidas a la protección personal, empleo criterioso de los antisépticos, desinfectantes, métodos adecuados de esterilización y tratamiento de residuos patogénicos. Para esta segunda parte, el protocolo propuesto contiene las acciones durante la atención y comunes a todas las disciplinas en el que se incluyen: el examen para arribar a un diagnóstico según niveles de riesgo, el control de la infección bucal a nivel supragingival y dentario y el refuerzo del hospedero

Control de la infección en odontología: 1ra parte / Infection control in dentistry: 1st part

La atención Odontológica requiere de condiciones asépticas y para lograrlas se deben implementar medidas referidas a la protección personal, empleo criterioso de los antisépticos, desinfectantes, métodos adecuedos de esterilización y tratamiento de residuos patogénicos. El protocolo propuesto para esta primera parte incluye las inmunizaciones recomendadas para el equipo de salud. En la preparación previa a la atención, se describen la indumentaria apropiada, las características de los métodos utilizados como barrera, la preparación personal del operador y ayudante, el tratamiento del equipo dental y la organización de la mesa de trabajo. Dentro del marco de control de la infección la confección de la historia médico-odontológica y de dieta es de importancia en la futura relación paciente-profesional. Es aconsejable la adecuación y actualización permanente de los protocolos de bioseguridad